71 genes were found for organism Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Jann_4213  CDS  NC_007801  85207  86046  +  840  methyltransferase FkbM  YP_512224  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4214  CDS  NC_007801  93  1505  -  1413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  YP_507942  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4215  CDS  NC_007801  1874  2608  +  735  protein tyrosine/serine phosphatase  YP_512155  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4216  CDS  NC_007801  2778  4175  +  1398  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  YP_512156  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4217  CDS  NC_007801  4210  5064  -  855  lipid A biosynthesis acyltransferase  YP_512157  normal  0.557701  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4218  CDS  NC_007801  5297  6871  -  1575  Allergen V5/Tpx-1 related  YP_512158  normal  0.245286  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4219  CDS  NC_007801  7171  7488  +  318  hypothetical protein  YP_512159  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4220  CDS  NC_007801  7559  8539  +  981  ParB-like nuclease  YP_512160  normal  0.95609  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4221  CDS  NC_007801  8678  9010  -  333  hypothetical protein  YP_512161  normal  0.634449  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4222  CDS  NC_007801  9010  9285  -  276  hypothetical protein  YP_512162  normal  0.543591  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4223  CDS  NC_007801  9402  9599  +  198  CP4-like integrase  YP_512163  normal  0.11664  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4224  CDS  NC_007801  9639  9884  -  246  conjugal transfer TraD  YP_512164  normal  0.0545637  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4225  CDS  NC_007801  9886  10224  -  339  hypothetical protein  YP_512165  normal  0.0454251  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4226  CDS  NC_007801  10385  13387  +  3003  conjugal transfer relaxase TraA  YP_512166  decreased coverage  0.0036143  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4227  CDS  NC_007801  13711  14265  +  555  antirestriction protein  YP_512167  normal  0.0722776  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4228  CDS  NC_007801  14262  14525  +  264  hypothetical protein  YP_512168  normal  0.281135  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4229  CDS  NC_007801  14819  15145  +  327  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  YP_512169  normal  0.289876  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4230  CDS  NC_007801  15281  16321  +  1041  IS30 family transposase  YP_512170  normal  0.382634  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4231  CDS  NC_007801  16370  18079  +  1710  glucose sorbosone dehydrogenase  YP_512171  normal  0.496798  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4232  CDS  NC_007801  18691  19149  -  459  hypothetical protein  YP_512172  normal  0.281804  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4233  CDS  NC_007801  19228  19863  -  636  rhomboid-like protein  YP_512173  normal  0.386042  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4234  CDS  NC_007801  19878  21260  -  1383  hypothetical protein  YP_512174  normal  0.998835  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4235  CDS  NC_007801  21299  21916  -  618  polysaccharide export protein  YP_512175  normal  0.694304  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4236  CDS  NC_007801  22053  24527  -  2475  tetratricopeptide TPR_2  YP_512176  normal  0.707034  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4237  CDS  NC_007801  24657  25397  -  741  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  YP_512177  normal  0.952439  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4238  CDS  NC_007801  25799  26863  +  1065  ATPase  YP_512178  normal  0.614005  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4239  CDS  NC_007801  26860  28413  +  1554  lipopolysaccharide biosynthesis  YP_512179  normal  0.0553335  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4240  CDS  NC_007801  28440  29297  +  858  chromosome partitioning ATPase protein-like  YP_512180  normal  0.335949  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4241  CDS  NC_007801  29475  30509  +  1035  hypothetical protein  YP_512181  normal  0.954159  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4242  CDS  NC_007801  30524  31105  -  582  phosphoheptose isomerase  YP_512182  normal  0.782615  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4243  CDS  NC_007801  31302  32834  +  1533  hypothetical protein  YP_512183  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4244  CDS  NC_007801  32883  34136  +  1254  glycosyl transferase, group 1  YP_512184  normal  1  normal  0.772955  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4245  CDS  NC_007801  34133  35119  +  987  GHMP kinase  YP_512185  normal  1  normal  0.469148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4246  CDS  NC_007801  35136  36257  +  1122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_512186  normal  1  normal  0.466913  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4247  CDS  NC_007801  36261  36983  +  723  nucleotidyl transferase  YP_512187  normal  1  normal  0.432694  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4248  CDS  NC_007801  36980  37555  +  576  D-alpha,beta-D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  YP_512188  normal  1  normal  0.414586  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4249  CDS  NC_007801  37552  38535  +  984  UDP-galactose 4-epimerase  YP_512189  normal  1  normal  0.444052  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4250  CDS  NC_007801  38630  39400  +  771  methyltransferase FkbM  YP_512190  normal  1  normal  0.155825  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4251  CDS  NC_007801  39397  40569  +  1173  glycosyl transferase, group 1  YP_512191  normal  1  normal  0.170492  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4252  CDS  NC_007801  40566  42146  -  1581  hypothetical protein  YP_512192  normal  1  normal  0.189681  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4253  CDS  NC_007801  42189  43622  -  1434  hypothetical protein  YP_512193  normal  1  normal  0.326142  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4254  CDS  NC_007801  43997  45394  +  1398  polysaccharide biosynthesis protein  YP_512194  normal  1  normal  0.16434  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4255  CDS  NC_007801  45410  46402  -  993  glycosyl transferase family protein  YP_512195  normal  1  normal  0.139043  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4256  CDS  NC_007801  46399  47409  -  1011  glycosyl transferase family protein  YP_512196  normal  0.586342  normal  0.139884  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4257  CDS  NC_007801  47411  48967  -  1557  hypothetical protein  YP_512197  normal  0.146201  normal  0.151056  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4258  CDS  NC_007801  49043  49867  -  825  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_512198  normal  1  normal  0.134206  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4259  CDS  NC_007801  50168  50425  +  258  hypothetical protein  YP_512199  normal  1  normal  0.123487  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4260  CDS  NC_007801  50425  51357  +  933  hypothetical protein  YP_512200  normal  1  normal  0.138316  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4261  CDS  NC_007801  51357  52247  +  891  hypothetical protein  YP_512201  normal  1  normal  0.0752478  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4262  CDS  NC_007801  52244  54412  +  2169  hypothetical protein  YP_512202  normal  1  normal  0.0455013  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4263  CDS  NC_007801  54919  58098  +  3180  hypothetical protein  YP_512203  normal  1  normal  0.114223  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4264  CDS  NC_007801  58149  59114  -  966  ParB-like nuclease  YP_512204  normal  1  normal  0.373587  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4265  CDS  NC_007801  59129  60517  -  1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_512205  normal  1  normal  0.383224  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4266  CDS  NC_007801  60909  61907  +  999  hypothetical protein  YP_512206  normal  0.932297  normal  0.331154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4267  CDS  NC_007801  61929  62321  -  393  hypothetical protein  YP_512207  normal  1  normal  0.317824  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4268  CDS  NC_007801  62318  63904  -  1587  FAD dependent oxidoreductase  YP_512208  normal  1  normal  0.3626  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4269  CDS  NC_007801  63982  64998  +  1017  sulfotransferase  YP_512209  normal  1  normal  0.19629  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4270  CDS  NC_007801  64995  66104  +  1110  glycosyl transferase family protein  YP_512210  normal  1  normal  0.338502  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4271  CDS  NC_007801  66128  67732  -  1605  hypothetical protein  YP_512211  normal  1  normal  0.331154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4272  CDS  NC_007801  67846  69132  -  1287  glycosyl transferase, group 1  YP_512212  normal  0.553747  normal  0.320513  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4273  CDS  NC_007801  69312  70244  +  933  glycosyl transferase family protein  YP_512213  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4274  CDS  NC_007801  70326  71000  -  675  hypothetical protein  YP_512214  unclonable  0.0000000000240713  normal  0.501804  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4275  CDS  NC_007801  71452  72267  +  816  glycosyl transferase family protein  YP_512215  hitchhiker  0.0000150665  normal  0.321914  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4276  CDS  NC_007801  72402  73121  +  720  methyltransferase FkbM  YP_512216  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4277  CDS  NC_007801  73289  74368  -  1080  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  YP_512217  normal  1  normal  0.52167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4278  CDS  NC_007801  74399  76177  -  1779  ABC transporter related  YP_512218  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4279  CDS  NC_007801  76416  77585  +  1170  glycosyl transferase, group 1  YP_512219  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4280  CDS  NC_007801  77871  78908  +  1038  GDP-mannose 4,6-dehydratase  YP_512220  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4281  CDS  NC_007801  79019  79819  +  801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_512221  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4282  CDS  NC_007801  79995  81224  +  1230  methyltransferase FkbM  YP_512222  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4283  CDS  NC_007801  81224  84913  +  3690  glycosyl transferase, group 1  YP_512223  normal  1  normal  1  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>