23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4224 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  82.72 
 
 		 81 aa  136  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  72.6 
 
 		 81 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  63.29 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  64.56 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  64.56 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  70.83 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  60.76 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  63.16 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  58.23 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  58.02 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  68.12 
 
 		 78 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  65.75 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3193  conjugal transfer TraD  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0328  conjugal transfer TraD family protein  46.67 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  52.24 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3573  Conjugal transfer TraD family protein  47.37 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0180  conjugal transfer TraD family protein  61.22 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  54.72 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  47.69 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4243  hypothetical protein  39.44 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326888  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  50 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  42.19 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>