19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1150 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  100 
 
 		 76 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0328  conjugal transfer TraD family protein  86.76 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3193  conjugal transfer TraD  71.64 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3573  Conjugal transfer TraD family protein  58.67 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  54.93 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  51.9 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  56.06 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  54.05 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  58.46 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  55.22 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  55.22 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  50 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  53.73 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  52.24 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0180  conjugal transfer TraD family protein  72.92 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  48.65 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  52.24 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  50.75 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>