22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0440 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  100 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  79.71 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  74.65 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  76.81 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  76.81 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  68 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  71.01 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  71.01 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  69.57 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  68.12 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  65.75 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  63.75 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  60.81 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3193  conjugal transfer TraD  57.97 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  54.93 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0328  conjugal transfer TraD family protein  54.41 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3573  Conjugal transfer TraD family protein  62.75 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0180  conjugal transfer TraD family protein  63.04 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  45.31 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  48 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4243  hypothetical protein  44.44 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326888  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  47.83 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>