269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4231 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4231  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 569 aa  1164    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.496798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0530  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 422 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  33.78 
 
 		 387 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  36.96 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  34.91 
 
 		 368 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  36.56 
 
 		 465 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  37.16 
 
 		 382 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  39.88 
 
 		 375 aa  95.1  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  38.41 
 
 		 408 aa  94.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  39.73 
 
 		 377 aa  94  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  35.05 
 
 		 394 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  36.63 
 
 		 378 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  35.08 
 
 		 430 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  36.81 
 
 		 404 aa  91.3  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  37.84 
 
 		 405 aa  90.9  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  33.55 
 
 		 466 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  39.86 
 
 		 399 aa  90.5  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  90.5  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.17 
 
 		 410 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32.97 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 		 378 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  30.2 
 
 		 391 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  34.07 
 
 		 392 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.96 
 
 		 387 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  33.13 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  31.47 
 
 		 360 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  37.04 
 
 		 394 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 		 382 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 		 396 aa  87.4  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.69 
 
 		 400 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  35.58 
 
 		 382 aa  87  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  39.26 
 
 		 384 aa  87  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  39.33 
 
 		 375 aa  87  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 392 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  37.04 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  36.81 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  34.93 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  33.76 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  33.95 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  35.4 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  36.42 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  26.5 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  35.15 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  31.31 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.76 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.95 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  35.33 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  34.42 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.16 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  36 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  35.17 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  35.14 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  30.88 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2752  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 		 435 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03425  dehydrogenase with soluble quinoprotein glucose dehydrogenase domain  34.01 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  31.91 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.21 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  34 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.7 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1013  putative dehydrogenase  33.72 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.777049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  33.74 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  36.99 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  32.65 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  33.54 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.92 
 
 		 371 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.92 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>