More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1013 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1013  putative dehydrogenase  100 
 
 
226 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.777049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  96.39 
 
 
373 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  75.86 
 
 
371 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  79.63 
 
 
371 aa  278  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  74.23 
 
 
372 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  61.88 
 
 
388 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  61.88 
 
 
388 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  63.8 
 
 
381 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  62.89 
 
 
374 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  55.26 
 
 
382 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  63.19 
 
 
381 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  56.32 
 
 
383 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  61.59 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  61.25 
 
 
381 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  60.74 
 
 
382 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  60.37 
 
 
381 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  60 
 
 
383 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  56.44 
 
 
387 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  53.99 
 
 
387 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  53.37 
 
 
376 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  51.53 
 
 
388 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  48.78 
 
 
375 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  51.22 
 
 
391 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  47.85 
 
 
382 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  49.7 
 
 
387 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  50.92 
 
 
383 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  51.83 
 
 
387 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  47.46 
 
 
376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  50.31 
 
 
382 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  51.23 
 
 
405 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  47.53 
 
 
375 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  48.77 
 
 
387 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  49.69 
 
 
405 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  49.69 
 
 
360 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  44.79 
 
 
400 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  45.4 
 
 
400 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  47.59 
 
 
397 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  45.4 
 
 
397 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  45.4 
 
 
406 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  49.69 
 
 
396 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.75 
 
 
412 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  49.07 
 
 
396 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  40.2 
 
 
432 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  43.42 
 
 
405 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  41.15 
 
 
392 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  39.7 
 
 
428 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  43.68 
 
 
399 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  48.47 
 
 
402 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  47.56 
 
 
384 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  39.7 
 
 
428 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  46.25 
 
 
407 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  45.78 
 
 
395 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  44.17 
 
 
388 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  45.51 
 
 
391 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  44.17 
 
 
377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  44.91 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  45 
 
 
408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  48.32 
 
 
392 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  40.74 
 
 
465 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  46.53 
 
 
410 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  42.94 
 
 
476 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  42.33 
 
 
366 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  42.86 
 
 
389 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  38.76 
 
 
466 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  46.11 
 
 
378 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  45.66 
 
 
392 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  43.9 
 
 
374 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  43.11 
 
 
380 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  43.98 
 
 
418 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  43.37 
 
 
430 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  43.11 
 
 
406 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  44.17 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  43.29 
 
 
374 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  42.24 
 
 
403 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.9 
 
 
391 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  40.49 
 
 
386 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  40.62 
 
 
404 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  43.12 
 
 
413 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  43.79 
 
 
462 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.1 
 
 
378 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  37.91 
 
 
530 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  40.37 
 
 
382 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  40.85 
 
 
370 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  40.85 
 
 
369 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  40.22 
 
 
376 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  39.55 
 
 
386 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  41.1 
 
 
382 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  42.94 
 
 
369 aa  121  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  41.46 
 
 
395 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 
369 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  42.24 
 
 
394 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  41.46 
 
 
395 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  33.18 
 
 
368 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>