199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03425 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03425  dehydrogenase with soluble quinoprotein glucose dehydrogenase domain  100 
 
 		 404 aa  823    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  37.3 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  31.07 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.69 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.14 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  28.75 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 		 375 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32.5 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.29 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.21 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  30.17 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  30.28 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.84 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.22 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.18 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  28.15 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.03 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  31.69 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  30.56 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  30.91 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  30.21 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.2 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  30.39 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  28.64 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  27.11 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.77 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  32.02 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  27.59 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  28 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 394 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  26.82 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  29.62 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  29.62 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 371 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.9 
 
 		 388 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  29.62 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 371 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  29.62 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  28.5 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  29.62 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  29.62 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.75 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  28.02 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  29.17 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  28.38 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  27.62 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  27.42 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  27.81 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.12 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  29.4 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  26.8 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>