197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0530 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0530  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
422 aa  867    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.05 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  35.38 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  30.18 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  30.18 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  31.41 
 
 
384 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.89 
 
 
413 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 
392 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 
387 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 
383 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 
369 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 
396 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 
388 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  32.06 
 
 
370 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 
382 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 
388 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 
391 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4231  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 
569 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.496798  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  27.21 
 
 
402 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  28.14 
 
 
358 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.35 
 
 
387 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  27.46 
 
 
358 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 
376 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 
399 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
428 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
428 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 
375 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 
465 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  26.16 
 
 
432 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 
388 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  29.04 
 
 
366 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  26.94 
 
 
381 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
379 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  30.66 
 
 
410 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 
377 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.03 
 
 
380 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  26.95 
 
 
407 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.46 
 
 
371 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  31.82 
 
 
376 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 
395 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 
377 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  26.57 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  29.77 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  27.41 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.96 
 
 
400 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  28.8 
 
 
400 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  33.78 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  28.08 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  26.88 
 
 
359 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.13 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  29.74 
 
 
392 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.06 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  26.26 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.54 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.04 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  27.1 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 
382 aa  97.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  29.74 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.03 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  25.88 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  27.1 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  27.6 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  26.39 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  25.46 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  26.67 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  30.67 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  28.4 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.64 
 
 
392 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2752  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985036  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.35 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  25.98 
 
 
394 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  26.33 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  26.3 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  25.45 
 
 
466 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.04 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  30.09 
 
 
369 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 
462 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  26 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>