30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4220 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4220  ParB-like nuclease  100 
 
 		 326 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3999  ParB-like nuclease  75.91 
 
 		 242 aa  354  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524272  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3690  ParB-like nuclease  74.09 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  69.66 
 
 		 660 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  69.66 
 
 		 660 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  42.25 
 
 		 652 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  42.25 
 
 		 652 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  42.25 
 
 		 654 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  40.85 
 
 		 654 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  47.76 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  30.14 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  31.88 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  27.66 
 
 		 112 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  36.36 
 
 		 401 aa  46.2  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 645 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4159  hypothetical protein  31.94 
 
 		 107 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0695762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  36.51 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  31.88 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6196  protein of unknown function DUF736  33.8 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0437293  normal  0.0143768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  34.29 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2501  hypothetical protein  29.73 
 
 		 106 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.645189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.82 
 
 		 658 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  33.87 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2633  hypothetical protein  32.39 
 
 		 106 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 278 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  35.21 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>