81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4159 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4159  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  220  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0695762  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6196  protein of unknown function DUF736  72.64 
 
 
107 aa  166  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0437293  normal  0.0143768 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4228  hypothetical protein  70.75 
 
 
107 aa  153  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2633  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2501  hypothetical protein  58.25 
 
 
106 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.645189  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1817  hypothetical protein  39.42 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  38.04 
 
 
108 aa  59.3  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2233  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  34.62 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  34.62 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  32.67 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  40.26 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  35.35 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  34.65 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  43.04 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  36 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  38.96 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  31.37 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  31.37 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  36.54 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  34.65 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  34 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  40.51 
 
 
112 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  33.65 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  37.66 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  31.68 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  31.68 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2013  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  30.69 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  30.61 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  34.34 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  32.38 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  37.66 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  31.48 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  34.95 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  32.38 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  36.78 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  32.08 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  36.26 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  29.81 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  33.67 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  32.38 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3690  ParB-like nuclease  33.33 
 
 
242 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456588  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  35.8 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  35.06 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  34.48 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  30.48 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  32.67 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  31.68 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  33.7 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4220  ParB-like nuclease  31.94 
 
 
326 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  35.44 
 
 
353 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  35 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3999  ParB-like nuclease  31.94 
 
 
242 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  35.29 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  31.07 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  34.91 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  30.48 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  30.48 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  30.48 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  31.63 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  34.09 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3374  hypothetical protein  34.25 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  30.61 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  32.47 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  30.48 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  32.47 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3184  hypothetical protein  33.8 
 
 
112 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  28.85 
 
 
192 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  33.68 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3081  protein of unknown function DUF736  34.15 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  35.21 
 
 
310 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>