72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2633 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2633  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2501  hypothetical protein  83.02 
 
 		 106 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.645189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4228  hypothetical protein  74.04 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6196  protein of unknown function DUF736  64.42 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0437293  normal  0.0143768 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4159  hypothetical protein  61.17 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0695762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1817  hypothetical protein  43.93 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2233  hypothetical protein  37.96 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2013  hypothetical protein  37.14 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  35.85 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  32.97 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  37.62 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  37.62 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  38.1 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  41.75 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  34.62 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  38.61 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  35.85 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  36.36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  38.64 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  36.36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  37.74 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  36.45 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  34.58 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  36.79 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  33 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  36.19 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  36.19 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  38.64 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  36.94 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  35.23 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  31.73 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  34.62 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  34.58 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  36.26 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  36.11 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  35.23 
 
 		 353 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  31.78 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  32.41 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  31.78 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3081  protein of unknown function DUF736  36.14 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  37.5 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  30.19 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  33.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  33.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  32.91 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  30.63 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3374  hypothetical protein  34.18 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  33.02 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  30.19 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1845  hypothetical protein  32.05 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.820476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  31.48 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2621  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  27.78 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3690  ParB-like nuclease  30.99 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4220  ParB-like nuclease  32.39 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3999  ParB-like nuclease  30.99 
 
 		 242 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  32.91 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1604  protein of unknown function DUF736  31.65 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3846  hypothetical protein  31.82 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0411247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0705  hypothetical protein  31.96 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>