114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0280 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  237  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  82.61 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  83.5 
 
 		 102 aa  184  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  80.77 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  80.58 
 
 		 103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  77.67 
 
 		 103 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  90 
 
 		 104 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  68.97 
 
 		 116 aa  166  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  66.99 
 
 		 103 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  65.38 
 
 		 104 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  62.5 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  50.44 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  58.1 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  57.14 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  54.24 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  105  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  53.77 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  54.29 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  51.89 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  53.77 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  58.1 
 
 		 343 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  52.54 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  55.56 
 
 		 353 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  57.14 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  49.57 
 
 		 183 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  56.19 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  56.19 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  55.24 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  54.81 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  54.29 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  55.24 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  57 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  54.29 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  55.24 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  49.51 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2497  hypothetical protein  51.46 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  56.31 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7420  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  48.31 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  48.31 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  51.43 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  51.4 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  49.5 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  53.47 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  54.29 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  51.46 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  51.46 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  49.52 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  49.52 
 
 		 136 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  49.53 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  44.34 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  50.48 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  48.54 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  49.04 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  48.54 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  45 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1845  hypothetical protein  43.56 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.820476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0369  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  42.59 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5047  hypothetical protein  61.9 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0986  protein of unknown function DUF736  44.9 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00218304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  38.89 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  39.66 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2235  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  37.96 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  36.45 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2037  hypothetical protein  41.75 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0705  hypothetical protein  38.02 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9580  hypothetical protein  80 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133051  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8120  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0478083  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5357  hypothetical protein  35.14 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  36.45 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  35.51 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3675  hypothetical protein  40.45 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1509  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8121  hypothetical protein  61.7 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0292425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  34.58 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3190  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0482077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  33.64 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  32.71 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3184  hypothetical protein  35.51 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3081  protein of unknown function DUF736  36.36 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1604  protein of unknown function DUF736  34.58 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3374  hypothetical protein  35.51 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1817  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  32.11 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3846  hypothetical protein  32.29 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0411247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>