112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3915 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  95.33 
 
 		 107 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7420  hypothetical protein  87.85 
 
 		 118 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0369  hypothetical protein  77.57 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  78.64 
 
 		 106 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  77.78 
 
 		 108 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  77.36 
 
 		 107 aa  171  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  72.9 
 
 		 107 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  72.9 
 
 		 169 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  76.42 
 
 		 108 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  75 
 
 		 183 aa  167  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  75 
 
 		 108 aa  166  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  77.57 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  77.57 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  79.21 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  75.7 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  74.07 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  79.21 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  72.9 
 
 		 107 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  75.7 
 
 		 108 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  75.25 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  75.25 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  73.15 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  62.26 
 
 		 105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  52.83 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  56 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  61 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2497  hypothetical protein  59.22 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0986  protein of unknown function DUF736  51.92 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00218304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  53.7 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  53.21 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  51.96 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  50.93 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  50.98 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  51.85 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  50.93 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  49.07 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  49.02 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  49.02 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  48.08 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  51.46 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  48.54 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  48.04 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  45.71 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  50.49 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  50.49 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  48.04 
 
 		 353 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  49.02 
 
 		 343 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  46.79 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1845  hypothetical protein  46.53 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.820476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  47.57 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2037  hypothetical protein  45.87 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8120  hypothetical protein  73.47 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0478083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  45.1 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  45.1 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  44.95 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  39.25 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  43.52 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0705  hypothetical protein  41.44 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  45.71 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  41.9 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2342  hypothetical protein  61.19 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  47.87 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  40.54 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  37.61 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  43.24 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  43.24 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  38.32 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  40.74 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  33.93 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3190  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0482077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3081  protein of unknown function DUF736  39.64 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3184  hypothetical protein  37.38 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1509  hypothetical protein  37.96 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3374  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  39.25 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1817  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1604  protein of unknown function DUF736  36.94 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5357  hypothetical protein  28.32 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3675  hypothetical protein  38.2 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2235  hypothetical protein  34 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5047  hypothetical protein  62.22 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5174  hypothetical protein  33.94 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2621  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>