71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5047 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5047  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5397  hypothetical protein  95.59 
 
 		 303 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  78.18 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  81.63 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  77.55 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  61.9 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  60.32 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  57.14 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  63.49 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  58.73 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  65.22 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8120  hypothetical protein  53.12 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0478083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  60.42 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  67.5 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  61.22 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  63.04 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  62.22 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  63.64 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  72.22 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  63.64 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  54.9 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  63.64 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  62.22 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7420  hypothetical protein  67.44 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  72.22 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  72.22 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  72.22 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  61.36 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  53.7 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  61.36 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  71.43 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  71.43 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  64.86 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  71.43 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  69.44 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0369  hypothetical protein  61.36 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  69.44 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  70.27 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  71.43 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  59.09 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  66.67 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  65 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  65 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  52.5 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  52.5 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2497  hypothetical protein  46.03 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  62.16 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  64.86 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  62.16 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  62.16 
 
 		 353 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  59.46 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  59.46 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  56.76 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  59.46 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  57.89 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0986  protein of unknown function DUF736  52.38 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00218304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  58.97 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  59.46 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  56.76 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1845  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.820476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  55.56 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>