112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7724 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  96.26 
 
 
107 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  92.38 
 
 
108 aa  200  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  88.89 
 
 
108 aa  197  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  85.05 
 
 
107 aa  195  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  85.19 
 
 
108 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  85.19 
 
 
108 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  83.33 
 
 
108 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  79.34 
 
 
120 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  79.34 
 
 
120 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  80.37 
 
 
107 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  80.56 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  82.86 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  80.56 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  82.86 
 
 
107 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  77.48 
 
 
136 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7420  hypothetical protein  71.93 
 
 
118 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  77.78 
 
 
108 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  74.76 
 
 
106 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  72.9 
 
 
107 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0369  hypothetical protein  71.96 
 
 
107 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  70.09 
 
 
107 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  73.15 
 
 
107 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  66.35 
 
 
105 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  58.65 
 
 
105 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2497  hypothetical protein  64.42 
 
 
104 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194565  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  60.95 
 
 
105 aa  131  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  54.72 
 
 
118 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  55.75 
 
 
116 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  59.05 
 
 
102 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  50.44 
 
 
115 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0986  protein of unknown function DUF736  48.57 
 
 
105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00218304  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  42.42 
 
 
192 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  56.73 
 
 
103 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  51.85 
 
 
103 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  53.85 
 
 
103 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8120  hypothetical protein  78.95 
 
 
65 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0478083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  41.77 
 
 
353 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  43.07 
 
 
343 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  46.67 
 
 
105 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  50.98 
 
 
104 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  45.54 
 
 
117 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  47.01 
 
 
118 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  46.43 
 
 
117 aa  94.4  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  49 
 
 
104 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8119  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00762818  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8111  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0332077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  45.87 
 
 
104 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  47 
 
 
104 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  49.5 
 
 
103 aa  88.6  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  49.5 
 
 
102 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  41.82 
 
 
112 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  47 
 
 
104 aa  88.2  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  46 
 
 
104 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  46 
 
 
104 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  45 
 
 
104 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  54.84 
 
 
104 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  41.82 
 
 
111 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  44 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  45 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  48.04 
 
 
99 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  48.04 
 
 
99 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  48.51 
 
 
103 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  41.96 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  40.74 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  44.55 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  37.96 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1199  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3536  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3711  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0736956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1845  hypothetical protein  44.12 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.820476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  37.27 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2037  hypothetical protein  44.04 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48805  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3081  protein of unknown function DUF736  39.29 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  37.96 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  35.19 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0705  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2803  protein of unknown function DUF736  36.7 
 
 
111 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  36.7 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  36.04 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1604  protein of unknown function DUF736  37.27 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3184  hypothetical protein  35.78 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1509  hypothetical protein  35.78 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3374  hypothetical protein  35.78 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  36.11 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2342  hypothetical protein  49.38 
 
 
118 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  33.05 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3190  hypothetical protein  32.11 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0482077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1817  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5186  hypothetical protein  36.11 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.093904  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5357  hypothetical protein  30.36 
 
 
111 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245972 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5174  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282662  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3675  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5236  hypothetical protein  34.26 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.642352 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5244  hypothetical protein  34.26 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>