34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9580 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9580  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  263  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133051  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  97.56 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  92.31 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  89.74 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  80 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  75 
 
 		 192 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  56.36 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8121  hypothetical protein  50.6 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  44.26 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  58.54 
 
 		 343 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  44.26 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  65.79 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  56.1 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  56.41 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  54.76 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  34.67 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  56.41 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  56.41 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  34.67 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  60.53 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  53.85 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  34.67 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  34.67 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  47.92 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  36.62 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  58.97 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  51.35 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  65.52 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  51.28 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  54.35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  30.63 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>