53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8121 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8121  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0007  hypothetical protein  62 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0937165 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4326  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157691  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4484  hypothetical protein  56.9 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3810  hypothetical protein  52.63 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0280  hypothetical protein  61.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5520  protein of unknown function DUF736  65.96 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940581  hitchhiker  0.00249919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7309  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.119778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9572  hypothetical protein  65.96 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9580  hypothetical protein  50.6 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2080  protein of unknown function DUF736  59.57 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5399  hypothetical protein  58 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.870536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0840  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128749  hitchhiker  0.00366118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1509  protein of unknown function DUF736  54.55 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4161  hypothetical protein  40.26 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5043  hypothetical protein  52.94 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5046  hypothetical protein  52.94 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1135  protein of unknown function DUF736  41.03 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0462  hypothetical protein  49.02 
 
 		 343 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  44.83 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4760  hypothetical protein  44 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0216684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3531  protein of unknown function DUF736  43.1 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3029  hypothetical protein  43.1 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2615  protein of unknown function DUF736  43.1 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1248  hypothetical protein  47.06 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.021102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2613  hypothetical protein  41.38 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2644  hypothetical protein  47.06 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.614359  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2939  hypothetical protein  41.38 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  45.1 
 
 		 353 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2730  hypothetical protein  41.38 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9175  hypothetical protein  47.92 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0681  hypothetical protein  39.66 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2235  hypothetical protein  46.81 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  44.23 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  41.07 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0361  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3738  hypothetical protein  37.93 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3822  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2324  hypothetical protein  35.9 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4988  hypothetical protein  60.61 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0977  protein of unknown function DUF736  41.51 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3190  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0482077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2332  hypothetical protein  38.24 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0528759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0518  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0209902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3010  hypothetical protein  41.07 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  46 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2872  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1509  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0705  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  46 
 
 		 107 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>