14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3999 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3999  ParB-like nuclease  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524272  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3690  ParB-like nuclease  95.04 
 
 		 242 aa  476  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4220  ParB-like nuclease  75.91 
 
 		 326 aa  354  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0755  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60264 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4159  hypothetical protein  31.94 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0695762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1029  protein of unknown function DUF736  25.53 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169606  unclonable  2.39348e-22 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3715  hypothetical protein  34.29 
 
 		 105 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  0.0762661 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6196  protein of unknown function DUF736  32.39 
 
 		 107 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0437293  normal  0.0143768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2233  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1873  protein of unknown function DUF736  28.99 
 
 		 104 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3555  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2633  hypothetical protein  30.99 
 
 		 106 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1480  hypothetical protein  28.99 
 
 		 104 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.814908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>