More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4230 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  100 
 
 		 346 aa  722    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  48.3 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  50 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  49.63 
 
 		 333 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  49.63 
 
 		 333 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  49.63 
 
 		 333 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  51.49 
 
 		 243 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  46.49 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  34.56 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  31.6 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  31.6 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  31.6 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  31.6 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  31.6 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  35.85 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  35.85 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  35.85 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  33.58 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  33.83 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  33.83 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  33.82 
 
 		 421 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  32.96 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  34.43 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  31.37 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  31.29 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  31.29 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  31.29 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  32.22 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  32.6 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  31.25 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  32.23 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  31.54 
 
 		 386 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0736  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  30.71 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  30.91 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  30.42 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  31.62 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  34.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  34.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  34.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  34.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  34.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  31.25 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  34.8 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  34.8 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  34.8 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  32.51 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  30.74 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  34.35 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  32.03 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  34.22 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  34.23 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  31.36 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  28.46 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  28.46 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  28.46 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  28.46 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  28.46 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  31.36 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>