More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0141 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  100 
 
 
327 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  46.08 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  46.08 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  46.08 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  46.08 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  46.08 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  34.24 
 
 
339 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  33.43 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  33.43 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  35.12 
 
 
332 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.04 
 
 
342 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  36.53 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  36.34 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  36.34 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  36.13 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  36.13 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  36.13 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  36.13 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  36.13 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  34.73 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  33.86 
 
 
318 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  34.29 
 
 
386 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  32.12 
 
 
385 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  34.73 
 
 
343 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  32.12 
 
 
385 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  34.85 
 
 
336 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  35.41 
 
 
386 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  33.23 
 
 
326 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  33.23 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  32.83 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  35.35 
 
 
386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  32.63 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  33.54 
 
 
386 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  34.77 
 
 
335 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  34.77 
 
 
335 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  30.49 
 
 
339 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  30.49 
 
 
339 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  30.49 
 
 
339 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  31.09 
 
 
394 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 
315 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 
315 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  33.67 
 
 
315 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  34.77 
 
 
335 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 
380 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  33.54 
 
 
342 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  34.46 
 
 
335 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  34.58 
 
 
316 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  33.94 
 
 
386 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
408 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  34.77 
 
 
383 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  32.52 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  33.83 
 
 
386 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  34.85 
 
 
354 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  33.13 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  33.13 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  33.13 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  32.01 
 
 
343 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
519 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
496 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  34.54 
 
 
321 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
519 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
519 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>