More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0736 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0736  Integrase catalytic region  100 
 
 		 338 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  62.24 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  62.24 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  62.24 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  61.93 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  43.45 
 
 		 326 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  45.32 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  45.32 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  42.64 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  42.64 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  42.64 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  42.64 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  42.64 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 519 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 519 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 496 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 525 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 457 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  41.35 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  39.64 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 386 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  41.64 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  39 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  43.58 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  42.81 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  42.81 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  41.34 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  40.47 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  40.59 
 
 		 385 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  42.2 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  40.64 
 
 		 386 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  42.2 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  40.54 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  42.2 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  42.2 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  42.2 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 380 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  40.72 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  41.41 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  39.58 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  40.06 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  39.27 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  37.28 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  39.04 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 		 399 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 		 399 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  39.23 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  38.97 
 
 		 383 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  37.61 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  38.79 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  40.18 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  42.57 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  48.05 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  38.89 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  38.89 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  38.04 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  36.68 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  37.93 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  50.87 
 
 		 189 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>