More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3555 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  100 
 
 
317 aa  651    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  65.06 
 
 
399 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  65.06 
 
 
399 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 
401 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  62.78 
 
 
401 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  59.42 
 
 
400 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  50 
 
 
423 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  50 
 
 
423 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  50 
 
 
423 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  50 
 
 
423 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  50 
 
 
423 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  50.99 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  50.99 
 
 
385 aa  281  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  46.93 
 
 
385 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  45.72 
 
 
326 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 
496 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 
525 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 
519 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 
519 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  46.93 
 
 
385 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 
519 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
519 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
519 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  46.6 
 
 
385 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  45.85 
 
 
380 aa  261  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  45.51 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  46.69 
 
 
334 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  46.69 
 
 
334 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  46.69 
 
 
334 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  46.51 
 
 
457 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  47.74 
 
 
386 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  47.74 
 
 
386 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  44.84 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 
386 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
479 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
479 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
479 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  44.55 
 
 
386 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  44.55 
 
 
342 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  41.14 
 
 
474 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  41.14 
 
 
474 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  41.14 
 
 
474 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  41.69 
 
 
414 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  41.69 
 
 
437 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  42.66 
 
 
402 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  41.69 
 
 
437 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  41.69 
 
 
437 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  41.69 
 
 
437 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  44.55 
 
 
386 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 
386 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  49.44 
 
 
421 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  41.41 
 
 
453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  45.87 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 
370 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  40.11 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  40.11 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  40.11 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  40.11 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  40.11 
 
 
465 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  40.11 
 
 
465 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  42.7 
 
 
466 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  40.45 
 
 
480 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  40.45 
 
 
480 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  39.84 
 
 
465 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  42.7 
 
 
481 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  40.56 
 
 
465 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  41.99 
 
 
342 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  42.13 
 
 
466 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.55 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  44.44 
 
 
394 aa  222  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  43.61 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>