More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2436 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  100 
 
 
338 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  99.7 
 
 
338 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  100 
 
 
338 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  100 
 
 
338 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0736  Integrase catalytic region  62.24 
 
 
338 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
519 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
519 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
519 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
496 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
519 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
525 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  47.63 
 
 
519 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  44.38 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  44.38 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  44.38 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  44.38 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  44.38 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  43.07 
 
 
326 aa  242  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  43.2 
 
 
385 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  43.2 
 
 
385 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 
380 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  42.06 
 
 
386 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  42.52 
 
 
386 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  43.02 
 
 
334 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  43.02 
 
 
334 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  42.4 
 
 
342 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  42.06 
 
 
385 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  42.73 
 
 
334 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  42.86 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  41.69 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  41.64 
 
 
386 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  41.64 
 
 
386 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  43.17 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  43.45 
 
 
408 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  41.18 
 
 
385 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  41.52 
 
 
386 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  40.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  42.94 
 
 
386 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  40.15 
 
 
402 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
457 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  42.23 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  42.23 
 
 
383 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  42.23 
 
 
383 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  42.23 
 
 
383 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  42.23 
 
 
383 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  42.23 
 
 
383 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  41.09 
 
 
343 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  41.94 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  42.06 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  40.96 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  40.96 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  43.85 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  43.85 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  43.85 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  43.85 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 
386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  40.42 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  47.12 
 
 
336 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  40.94 
 
 
386 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  41.74 
 
 
340 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  39.94 
 
 
401 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  42.86 
 
 
409 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  42.02 
 
 
421 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 
370 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 
342 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  39.58 
 
 
401 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  40.23 
 
 
394 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  40.3 
 
 
342 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  41.03 
 
 
339 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  39.03 
 
 
466 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>