More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13211 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13211  transposase  100 
 
 
394 aa  799    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  48.84 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
519 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
519 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
519 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
519 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
519 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  45.21 
 
 
496 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  45.21 
 
 
525 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  46.08 
 
 
423 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  46.08 
 
 
423 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  46.08 
 
 
423 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  46.08 
 
 
423 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  46.08 
 
 
423 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  42.56 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  42.93 
 
 
399 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  42.93 
 
 
399 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  40.87 
 
 
401 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  41.45 
 
 
385 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  41.45 
 
 
385 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  40.6 
 
 
466 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  40.05 
 
 
481 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  41.56 
 
 
402 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
437 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
437 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
437 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
437 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  37.13 
 
 
453 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  43.13 
 
 
326 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
474 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
474 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 
474 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  37.79 
 
 
465 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  36.24 
 
 
479 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  36.24 
 
 
479 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  36.24 
 
 
479 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  45.07 
 
 
421 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  41.19 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  41.19 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  43.37 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  36.38 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  36.38 
 
 
465 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  36.2 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  36.2 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  36.38 
 
 
465 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  36.38 
 
 
465 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  36.38 
 
 
465 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  36.38 
 
 
465 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  36.82 
 
 
414 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  40.88 
 
 
385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  36.16 
 
 
465 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  40.59 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 
342 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 
386 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 
386 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
317 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  40.33 
 
 
386 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
342 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  41.59 
 
 
326 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  41.59 
 
 
326 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  41.59 
 
 
326 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  41.59 
 
 
326 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  42.6 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  40 
 
 
386 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  39.82 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  42.42 
 
 
340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  40.85 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>