More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3263 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3263  integrase  100 
 
 		 189 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  84.97 
 
 		 326 aa  320  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  59.88 
 
 		 385 aa  221  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 457 aa  220  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  59.28 
 
 		 385 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 519 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 496 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 519 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 519 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 525 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 519 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 519 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  59.76 
 
 		 423 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  59.76 
 
 		 423 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  59.76 
 
 		 423 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  59.76 
 
 		 423 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  59.76 
 
 		 423 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  57.06 
 
 		 408 aa  204  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  53.76 
 
 		 342 aa  203  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  60.71 
 
 		 342 aa  203  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  53.18 
 
 		 342 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  60.12 
 
 		 386 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  56.8 
 
 		 342 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  54.17 
 
 		 342 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  53.41 
 
 		 339 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  53.41 
 
 		 339 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  53.41 
 
 		 339 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  59.52 
 
 		 386 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  56.63 
 
 		 380 aa  197  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  59.52 
 
 		 386 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  58.33 
 
 		 386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  60.54 
 
 		 409 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  58.33 
 
 		 386 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  57.83 
 
 		 386 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  55.62 
 
 		 340 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  56.02 
 
 		 380 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  54.71 
 
 		 356 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 401 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  54.71 
 
 		 356 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 401 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 465 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  54.95 
 
 		 402 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 465 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  59.88 
 
 		 253 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  53.59 
 
 		 465 aa  191  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 465 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 465 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 465 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 326 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 326 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 326 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 326 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 465 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  56.55 
 
 		 386 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  56.55 
 
 		 386 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 399 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 399 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  52.97 
 
 		 465 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  53.61 
 
 		 339 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 437 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 437 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 437 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 437 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 474 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 414 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 474 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0736  Integrase catalytic region  50.87 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 474 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  52.98 
 
 		 385 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  54.59 
 
 		 466 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  52.98 
 
 		 385 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  55.09 
 
 		 334 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  55.09 
 
 		 334 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  55.09 
 
 		 334 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  52.43 
 
 		 453 aa  185  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 479 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 479 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 		 479 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  52.38 
 
 		 317 aa  184  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  50.3 
 
 		 343 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 466 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 466 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  53.51 
 
 		 466 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>