More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4602 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  100 
 
 
333 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  77.34 
 
 
333 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  77.34 
 
 
333 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  77.34 
 
 
333 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  48.31 
 
 
336 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  48.77 
 
 
343 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  50 
 
 
346 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  49.78 
 
 
243 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  36.86 
 
 
332 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 
342 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  37.05 
 
 
386 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  34.24 
 
 
330 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  33.94 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  33.94 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  33.94 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  33.94 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.42 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  37.35 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  35.99 
 
 
317 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  38.66 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  38.66 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  38.66 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  34.06 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 
386 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 
386 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  35.71 
 
 
386 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  33.23 
 
 
383 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  35.71 
 
 
386 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  34.06 
 
 
380 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 
386 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  33.54 
 
 
385 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  35.95 
 
 
386 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  33.43 
 
 
317 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  33.54 
 
 
385 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  36.25 
 
 
423 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  36.25 
 
 
423 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  36.25 
 
 
423 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  36.25 
 
 
423 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  36.25 
 
 
423 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  32.93 
 
 
354 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  33.92 
 
 
342 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
519 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
519 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  32.34 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
519 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 
525 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  33.43 
 
 
385 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  33.85 
 
 
519 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  33.85 
 
 
519 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  33.54 
 
 
385 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  32.34 
 
 
401 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  33.54 
 
 
385 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  34.33 
 
 
326 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  32.63 
 
 
342 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
342 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  31.41 
 
 
356 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  31.41 
 
 
356 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  33.42 
 
 
402 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  32.4 
 
 
315 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  32.4 
 
 
315 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  32.4 
 
 
315 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 
335 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  32.26 
 
 
339 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 
335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 
335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  36.27 
 
 
400 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  34.94 
 
 
343 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  34.02 
 
 
339 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  34.02 
 
 
339 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  34.02 
 
 
339 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 
335 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 
399 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 
399 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  32.09 
 
 
315 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>