More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5446 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  100 
 
 		 343 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  47.15 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  48.77 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  47.85 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  47.85 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  47.85 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  46.61 
 
 		 243 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  46.49 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  36.9 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  36.9 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  36.9 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  37.84 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  37.84 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  36.36 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  39.17 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  37.39 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  36.34 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  35.31 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  37.86 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  35.31 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  36.34 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  37.61 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  38.51 
 
 		 386 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  37 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  38.05 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  34.93 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  32.63 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  37.76 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  33.43 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  33.43 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  33.43 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  33.43 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  37.01 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  36.18 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  36.71 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  35.07 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  35.74 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  31.5 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  36.73 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  35.12 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  35.12 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  35.12 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  35.12 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  35.12 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  34.36 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  34.36 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  35.61 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  34.78 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  34.63 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  35.31 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  36.12 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  36.12 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  33.63 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  35.78 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  35.69 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  33.33 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  36.31 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  34.23 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  34.41 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  34.52 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  33.69 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>