More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4598 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  100 
 
 		 336 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  75.74 
 
 		 243 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  48.02 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  48.02 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  46.85 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  48.3 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  33.73 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  33.73 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  33.73 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  33.73 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  33.73 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  38.37 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  34.71 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  34.71 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  34.71 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  39.24 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  35.48 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  35.1 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  39.24 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  39.24 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  36.63 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  36.83 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  36.83 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  36.95 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  37.88 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  35.42 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  34.81 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  37.99 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  34.22 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  37.97 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  37.99 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  32.52 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  34.53 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  35.74 
 
 		 400 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  34.82 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.48 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  33.63 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  34.12 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  34.12 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  34.12 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  34.12 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  34.12 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  35.24 
 
 		 423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  35.24 
 
 		 423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  35.24 
 
 		 423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  35.24 
 
 		 423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  35.24 
 
 		 423 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  33.83 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  32.12 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  32.12 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  32.12 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  35.71 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  34.23 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  32.12 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  34.8 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 		 496 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  34.51 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  36.86 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  33.82 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  33.63 
 
 		 519 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  33.63 
 
 		 519 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  33.94 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  33.12 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  33.72 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  33.72 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  34.43 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  30.89 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 		 479 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 		 479 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 		 479 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  32.26 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  34.29 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  34.29 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  34.29 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  34.29 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>