296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2532 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2532  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  893    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2387  hypothetical protein  96.98 
 
 		 430 aa  874    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1055  nickel-dependent hydrogenase large subunit  58.08 
 
 		 432 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0937  [NiFe] hydrogenase, alpha subunit, putative  58.19 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1263  hypothetical protein  52.46 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.321319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0507  nickel-dependent hydrogenase large subunit  46.82 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2590  nickel-dependent hydrogenase large subunit  47.53 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2660  Coenzyme F420 hydrogenase  45.18 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.041142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1138  nickel-dependent hydrogenase large subunit  45.71 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04400  Soluble nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxH  46.78 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4496  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  46.14 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.401222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1019  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.65 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3427  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.62 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4826  nickel-dependent hydrogenase large subunit  43.06 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3416  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.62 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3479  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.62 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.441341  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1858  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.55 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3474  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.42 
 
 		 432 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2605  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.1 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0537031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1929  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.49 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2132  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.78 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0448433  normal  0.0283043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2169  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  34.03 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0245  hydrogenase/sulfur reductase, alpha subunit  31.54 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2499  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.46 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0080  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.03 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.303597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1256  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.93 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0884  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.33 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912975  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1122  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.35 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0114  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  31.28 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1673  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.6 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.521628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2250  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.52 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0169608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2249  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.11 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0982  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.11 
 
 		 487 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1459  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.11 
 
 		 504 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.720227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1968  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.66 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1553  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.95 
 
 		 479 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1651  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.18 
 
 		 485 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1215  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.91 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3539  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.11 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2102  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.22 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.782605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3972  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.95 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000529156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2013  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.4 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1007  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.68 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0588  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  28.6 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3855  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.51 
 
 		 507 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3884  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.43 
 
 		 473 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0615  hydrogenase, group 3, VhuA subunit, putative  29.21 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0531  putative nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.16 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_553  nickel-dependent hydrogenase, group 3, large subunit  28.6 
 
 		 479 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0139726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0070  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.79 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.36 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4661  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.66 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2221  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.23 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.794889  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2555  NAD-reducing hydrogenase HoxS beta subunit  27.39 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3680  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.37 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0782936  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.86 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4043  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.93 
 
 		 473 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0198059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2716  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.82 
 
 		 479 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.75 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2476  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.6 
 
 		 473 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.795621  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0078  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.79 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0996  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.04 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2258  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.13 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2419  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.19 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.954862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3954  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.52 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2748  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.35 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0652  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  28.32 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4160  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.47 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0095  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.28 
 
 		 474 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0092  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.06 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.06 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1712  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  26.44 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3537  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.15 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0977  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.23 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1215  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.17 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1525  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.14 
 
 		 488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000894187  hitchhiker  0.00486844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4292  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.91 
 
 		 494 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4314  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.44 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1791  hydrogen dehydrogenase  26.34 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2718  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  26.02 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0073  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.94 
 
 		 410 aa  117  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.38 
 
 		 476 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.301961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.1 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509028  normal  0.183384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0649  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4162  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.06 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0906302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4306  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.48 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891144  normal  0.552071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0015  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2791  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.35 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.119602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.3 
 
 		 514 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2287  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  23.21 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.304616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2332  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.23 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1071  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.6 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2174  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.14 
 
 		 455 aa  92.8  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2023  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.89 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.113638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0273  nickel-dependent hydrogenase large subunit  23.7 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0452  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  22.22 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  20.82 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1248  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.89 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1400  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.81 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>