More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0375 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0375  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0400  30S ribosomal protein S3  99.08 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  69.27 
 
 		 227 aa  308  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  69.27 
 
 		 227 aa  308  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  69.05 
 
 		 223 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  70.67 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  70.67 
 
 		 244 aa  304  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  70.19 
 
 		 244 aa  301  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 223 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 226 aa  300  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  64.22 
 
 		 220 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  64.22 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 228 aa  297  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 236 aa  297  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 224 aa  295  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  68.57 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  65.02 
 
 		 223 aa  294  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  67.77 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  67.77 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  69.05 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  67.3 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 211 aa  292  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  66.83 
 
 		 295 aa  292  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 232 aa  292  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  63.01 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 233 aa  290  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 301 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 288 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 275 aa  288  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  69.23 
 
 		 229 aa  288  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 308 aa  287  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 271 aa  287  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 237 aa  287  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  65.02 
 
 		 249 aa  286  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  67.79 
 
 		 232 aa  286  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 232 aa  286  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1270  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00251085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  65.3 
 
 		 233 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 298 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 290 aa  285  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0439  30S ribosomal protein S3  62.96 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0792432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  67.79 
 
 		 230 aa  285  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 229 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  65.28 
 
 		 236 aa  284  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  64.29 
 
 		 210 aa  284  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  63.89 
 
 		 236 aa  284  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  62.67 
 
 		 228 aa  284  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  63.89 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  63.89 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 299 aa  284  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  68.27 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  63.72 
 
 		 218 aa  283  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  67.79 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  67.79 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 235 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  62.33 
 
 		 218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>