120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1459 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  65.41 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  64.78 
 
 		 190 aa  225  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  62.18 
 
 		 159 aa  213  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  61.54 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  63.52 
 
 		 159 aa  212  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  62.18 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  62.82 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  57.23 
 
 		 159 aa  203  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.09 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  59.12 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  59.12 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  56.6 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  59.12 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.75 
 
 		 159 aa  197  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  61.54 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50.94 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  47.8 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50.31 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50.31 
 
 		 182 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.54 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  48.75 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  48.75 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.16 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  44.59 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.67 
 
 		 392 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  42.67 
 
 		 399 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  35.43 
 
 		 172 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  36.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  36.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  36.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  36.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  42 
 
 		 392 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  38.26 
 
 		 593 aa  101  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  35.67 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  40.67 
 
 		 392 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  40.67 
 
 		 392 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  33.92 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  35.54 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  40.67 
 
 		 392 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  33.92 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  35.5 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  32.53 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  34.13 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  34.13 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  31.76 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  31.33 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  31.93 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  33.13 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  33.13 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  32.34 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  32.34 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  31.93 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.93 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.33 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  32.34 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  31.87 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.4 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.4 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.95 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.95 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  29.41 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.14 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  30.72 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  30.72 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  29.76 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  29.76 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  30.95 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  28.92 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  27.98 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  28.31 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.08 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  34.58 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  30.19 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  26.35 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  26.97 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  28.83 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  28.95 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  35.64 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.68 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  25.47 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>