108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0741 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  78.57 
 
 
157 aa  267  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.27 
 
 
159 aa  264  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  66.23 
 
 
159 aa  235  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  67.53 
 
 
159 aa  234  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.58 
 
 
159 aa  233  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  64.94 
 
 
159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  64.94 
 
 
159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  64.94 
 
 
190 aa  231  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.53 
 
 
159 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  59.09 
 
 
159 aa  199  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  59.09 
 
 
159 aa  199  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  54.55 
 
 
159 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  54.55 
 
 
159 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  54.55 
 
 
159 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  52.26 
 
 
159 aa  179  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  49.35 
 
 
159 aa  166  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  50 
 
 
159 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  48.7 
 
 
182 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  47.74 
 
 
160 aa  157  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  47.74 
 
 
160 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  44.81 
 
 
159 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  45.57 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.45 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.91 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.21 
 
 
159 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.21 
 
 
159 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  40.12 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  36.75 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  38.92 
 
 
172 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  38.92 
 
 
172 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  38.92 
 
 
172 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  38.92 
 
 
172 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  36.75 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  39.16 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  38.32 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.95 
 
 
392 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  42.95 
 
 
399 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  43.62 
 
 
593 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  42.28 
 
 
392 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  41.61 
 
 
392 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.09 
 
 
172 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  41.61 
 
 
392 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  33.73 
 
 
171 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  41.61 
 
 
392 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  33.14 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.91 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  35.54 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.91 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.91 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.32 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.32 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.32 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.32 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.32 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  32.54 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.13 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  33.13 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.73 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  32.53 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.12 
 
 
172 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  33.13 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  33.13 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.13 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  32.34 
 
 
172 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  32.34 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  32.34 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  30.72 
 
 
172 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  31.93 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  31.93 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  31.33 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  30.72 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  31.93 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  32.28 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  30.63 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  27.38 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  30.12 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.24 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  28.48 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  27.71 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  33.6 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.48 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  32 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  35.48 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  36.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.56 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  28.69 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>