172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3633 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  344  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  93.41 
 
 
167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  91.62 
 
 
167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.84 
 
 
167 aa  264  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  72.46 
 
 
167 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  49.43 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  40.12 
 
 
165 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.53 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  37.67 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  38.06 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.9 
 
 
165 aa  84  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  36.81 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.9 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  38.06 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  30.46 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.56 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  34.56 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  34.56 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  36.13 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.56 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  29.8 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  29.53 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  39.69 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  29.45 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  29.45 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  29.45 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.35 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.93 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  32.32 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.32 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  32.32 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  30.88 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  29.45 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.71 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.4 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  30.15 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  26.49 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  37.4 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  36.89 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  32.1 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.13 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  26.49 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  25.15 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  26.49 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  29.93 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.9 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  28.1 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  28 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  32.1 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.14 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  27.33 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  29.06 
 
 
132 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  30.52 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  25.83 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  26.53 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  29.14 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  25.97 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.14 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  30.46 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  29.14 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  26.22 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  23.65 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  24.18 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  26.45 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  24.84 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  27.07 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  29.6 
 
 
148 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4913  hypothetical protein  29.6 
 
 
148 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4863  putative cytoplasmic protein  29.6 
 
 
148 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.676773  normal  0.639801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>