117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1588 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  340  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  36.65 
 
 
161 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  39.53 
 
 
171 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  38.95 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  37.21 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  38.37 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  38.37 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  38.37 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  38.37 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  38.6 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  35.85 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  33.54 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  32.75 
 
 
172 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  34.71 
 
 
172 aa  99  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  34.71 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  34.71 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  34.12 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  33.54 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  30.68 
 
 
171 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  30.11 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  30.29 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  31.17 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  29.49 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  29.49 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  29.24 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  28.98 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  28.98 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  28.66 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  28.65 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  28.65 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  28.98 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  28.98 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  28.98 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  28.65 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.87 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.85 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.07 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  26.8 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.43 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.65 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.25 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.07 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.49 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.9 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.9 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.9 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  28.32 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  28.32 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.32 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.9 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  26.06 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  26.06 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  30.23 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.06 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  25.35 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  27.39 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  27.56 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  26.76 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  25.35 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  25.35 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  27.56 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  27.56 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  31.17 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  28.46 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.83 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.27 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  26.95 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.15 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  26.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  26.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.59 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  28.26 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.59 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  28.95 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.95 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.14 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  25.55 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2077  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00363318  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.29 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  27.38 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.29 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.57 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>