114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5212 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  337  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  47.13 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.62 
 
 
159 aa  157  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  45.22 
 
 
159 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  45.22 
 
 
159 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  45.22 
 
 
159 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  44.59 
 
 
159 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  44.59 
 
 
159 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  48.1 
 
 
160 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  48.1 
 
 
160 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  44.38 
 
 
159 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  43.95 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.57 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  43.31 
 
 
159 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.45 
 
 
159 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.57 
 
 
159 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  43.31 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  42.04 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.76 
 
 
159 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  44.59 
 
 
159 aa  141  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.13 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  40.13 
 
 
159 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  40.13 
 
 
159 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.5 
 
 
159 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  40.13 
 
 
190 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  43.35 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  42.11 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  41.25 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  41.67 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  41.67 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  41.67 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  41.67 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  41.67 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  41.07 
 
 
172 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  39.76 
 
 
172 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  38.32 
 
 
171 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  41.57 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.95 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  37.72 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  37.72 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  40.36 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  39.76 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  39.16 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  37.06 
 
 
172 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.5 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.5 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.5 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.5 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.5 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  36.75 
 
 
173 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  34.94 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  37.5 
 
 
172 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  34.94 
 
 
172 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.75 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  35.29 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.31 
 
 
172 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.31 
 
 
172 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  35.33 
 
 
172 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  35.33 
 
 
172 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  35.33 
 
 
172 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
172 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  39.07 
 
 
392 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
172 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
172 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.13 
 
 
172 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.07 
 
 
392 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  39.07 
 
 
399 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  38.41 
 
 
392 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  38.41 
 
 
392 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  38.41 
 
 
392 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.54 
 
 
171 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  33.93 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  33.93 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  38.82 
 
 
593 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  31.93 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  31.48 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  28.92 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  30.54 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  27.49 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  28.24 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.65 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  27.06 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  26.95 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  24.26 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  26.95 
 
 
163 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  23.21 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  23.08 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  26.49 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  23.98 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  24.06 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  24.06 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>