More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0421 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 343 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  58.19 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  66.78 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  56.69 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  53.13 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  49.71 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  49.71 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  52.55 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  50.59 
 
 		 346 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  50 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  50 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  48.08 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  48.82 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  46.53 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  46.42 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  48.11 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  50.3 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  48.11 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  50.3 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  49.06 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  48.82 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  51.49 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  50 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  49.85 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  43.1 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  46.79 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  48.17 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  50.62 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  48.9 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 405 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  47.27 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  48.75 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  49.4 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  46.95 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  46.95 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  49.36 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  50 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  47.33 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  41.09 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  44.03 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  39.49 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.7 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  42.16 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.66 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.22 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.79 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.26 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  35.46 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  42.42 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.07 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.26 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.13 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.16 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 		 835 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2369  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.24 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.01 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.37 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.88 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.21 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  34.03 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>