More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6195 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  99.42 
 
 		 346 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  100 
 
 		 346 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  92.77 
 
 		 346 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  91.93 
 
 		 347 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  91.93 
 
 		 347 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  91.35 
 
 		 347 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  80.87 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  91.33 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  76.8 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  65.74 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  61.31 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  58.06 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  58.06 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  53.35 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  52.58 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  54.67 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  55.29 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  49.38 
 
 		 405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  45.68 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  49.23 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  49.23 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  51.41 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  49.19 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  52.33 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  52.33 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  49.19 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  41 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  52.23 
 
 		 340 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  52.06 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  50.94 
 
 		 347 aa  241  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  50.96 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  52 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.6 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  51.28 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  51.28 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  51.28 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  51.28 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.13 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  46.28 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  48.37 
 
 		 340 aa  235  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.03 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  50 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  50.18 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  52.96 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  42.19 
 
 		 357 aa  222  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  38.01 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  38.67 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.19 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.72 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.66 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.76 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.91 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  38.49 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.37 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.37 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.02 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.54 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.1 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.59 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.64 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  37.82 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>