More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3533 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
352 aa  685    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  59 
 
 
372 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  55 
 
 
405 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  55.76 
 
 
405 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  56.54 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  57.14 
 
 
339 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  57.14 
 
 
332 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 
332 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  55.42 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  58.5 
 
 
345 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  55.49 
 
 
347 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  57.93 
 
 
340 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  57.64 
 
 
330 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  60.33 
 
 
340 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  58.94 
 
 
340 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  58.94 
 
 
340 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  58.94 
 
 
340 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  58.94 
 
 
340 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.61 
 
 
340 aa  292  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  58.56 
 
 
336 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  59.32 
 
 
340 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.75 
 
 
341 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.94 
 
 
340 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.9 
 
 
341 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.9 
 
 
341 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  57.04 
 
 
336 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  51.78 
 
 
337 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  51.46 
 
 
337 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  53.33 
 
 
340 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  53.99 
 
 
340 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  47.75 
 
 
344 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  49.84 
 
 
346 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  48.09 
 
 
323 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  47.59 
 
 
351 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  48.62 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  48.09 
 
 
349 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  48.09 
 
 
349 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  48.66 
 
 
348 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  47.08 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  46.96 
 
 
347 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  46.96 
 
 
347 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  48.76 
 
 
346 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  49.24 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  52.58 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  52.23 
 
 
346 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  49.15 
 
 
343 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  47.42 
 
 
347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  39.57 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  51.55 
 
 
346 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
371 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.89 
 
 
358 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  38.76 
 
 
357 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 
345 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  35.26 
 
 
356 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
323 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 
333 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 
327 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
327 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  33.89 
 
 
326 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  39.21 
 
 
342 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  39.21 
 
 
342 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  39.21 
 
 
342 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
314 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.02 
 
 
322 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
350 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
311 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
311 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
331 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.46 
 
 
324 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
320 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.56 
 
 
334 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  32.69 
 
 
335 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.02 
 
 
324 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
342 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.34 
 
 
311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.34 
 
 
311 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 
342 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.34 
 
 
311 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.02 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.34 
 
 
311 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.97 
 
 
327 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.92 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.51 
 
 
309 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
314 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.65 
 
 
327 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.95 
 
 
322 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.89 
 
 
323 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.78 
 
 
322 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
311 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.04 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>