More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2344 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  100 
 
 		 346 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  90.46 
 
 		 346 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  89.91 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  89.91 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  91.33 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  90.2 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  91.33 
 
 		 346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  82.08 
 
 		 345 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  76.8 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  63.03 
 
 		 351 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  59.82 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  55.62 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  55.62 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  54.18 
 
 		 348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  51.55 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  53.87 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  50.76 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  50.47 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 405 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  50.52 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  50.52 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  50.52 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  47.57 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  49.03 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  39.71 
 
 		 350 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  50.52 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 340 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.33 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  51 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  51 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  51 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  48.63 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  51 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  46.54 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  51 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  50.68 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  50.67 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  50.67 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  50.67 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  47.78 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  51.05 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  43.35 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  52.04 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.48 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  51.3 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  42.63 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  38.42 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  37.07 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  41.79 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.86 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.46 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.83 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.91 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  36.71 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.71 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.71 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.73 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.79 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.48 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.64 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.81 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.93 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.6 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  39.78 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.26 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.41 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>