More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1906 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  100 
 
 		 337 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  97.03 
 
 		 337 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  74.61 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  67.58 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  60.88 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.88 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  60.88 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  60.88 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  60.19 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  60.76 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  60.56 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  59.94 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  60.12 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  62.46 
 
 		 340 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.46 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.46 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  62.46 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  62.46 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  59.74 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  59.06 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.78 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.78 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.78 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  56.31 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  55.99 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.14 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  51.45 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  55.99 
 
 		 405 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  56.71 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  52.66 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  57.23 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  51.33 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  51.79 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  47.54 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  47.54 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  44.89 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  47.19 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  46.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  48.12 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  47.32 
 
 		 343 aa  222  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  47.33 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  47 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  46.11 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  45.22 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  46.67 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  41.12 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.16 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  39.41 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.01 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.21 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.66 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.01 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.62 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  38.83 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.92 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  38.51 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.69 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  38.94 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.29 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.5 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.98 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.62 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.71 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 835 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>