More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1416 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
347 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  67.58 
 
 
337 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  65.75 
 
 
337 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  64.56 
 
 
340 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  59.57 
 
 
339 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  59.57 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  59.57 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  60.37 
 
 
340 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  62.46 
 
 
345 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  54.9 
 
 
352 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  62.15 
 
 
336 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  61.59 
 
 
336 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  60.69 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  58.79 
 
 
330 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  61.32 
 
 
340 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.64 
 
 
340 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  61.64 
 
 
340 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  61.64 
 
 
340 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.64 
 
 
340 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  61.01 
 
 
340 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  53.97 
 
 
405 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  53.97 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  59.12 
 
 
346 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  54.14 
 
 
405 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.95 
 
 
341 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.95 
 
 
341 aa  308  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.64 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  54.23 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  54.11 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.01 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  58.23 
 
 
340 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  49.85 
 
 
344 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  50.5 
 
 
323 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  49.03 
 
 
348 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  50.31 
 
 
349 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  50.31 
 
 
349 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  49.53 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  49.83 
 
 
343 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  48.37 
 
 
347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  48.37 
 
 
347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  50.7 
 
 
345 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  48.63 
 
 
346 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  52.2 
 
 
346 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 
346 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  41.06 
 
 
350 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.14 
 
 
358 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 
343 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  45.96 
 
 
371 aa  215  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  48.37 
 
 
347 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  49.68 
 
 
346 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  41.54 
 
 
357 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  41.67 
 
 
356 aa  189  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  41.8 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  41.01 
 
 
345 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.87 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 
333 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.27 
 
 
324 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.54 
 
 
327 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.54 
 
 
327 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
322 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.86 
 
 
323 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
355 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.16 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.15 
 
 
334 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.15 
 
 
342 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 
342 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
342 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40 
 
 
309 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
342 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
342 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
310 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.31 
 
 
330 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.31 
 
 
330 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.31 
 
 
330 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.68 
 
 
322 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
312 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 
354 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  41.58 
 
 
326 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.62 
 
 
322 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
311 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  33.72 
 
 
355 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
311 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.69 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.98 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
835 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 
311 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.93 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  39.31 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.69 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2369  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 
325 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312447  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.37 
 
 
311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>