More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4854 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  98.24 
 
 		 340 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  98.53 
 
 		 340 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  98.24 
 
 		 340 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 341 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  98.24 
 
 		 340 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  97.94 
 
 		 340 aa  567  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  97.95 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  97.95 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  97.65 
 
 		 340 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  85.29 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  78.78 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  79.65 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  73.89 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  69.72 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  70.44 
 
 		 332 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  70.44 
 
 		 332 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  69.05 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  68.17 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  63.98 
 
 		 330 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  64.11 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  64.11 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  61.01 
 
 		 347 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  58.17 
 
 		 352 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  52.63 
 
 		 372 aa  325  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  55.65 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  57.78 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  57.78 
 
 		 405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  61.89 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  53.45 
 
 		 372 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  58.86 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  57.67 
 
 		 340 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  50.15 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  44.77 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  49.66 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  48.72 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  48.72 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  50.16 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  46.09 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  46.88 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  49.41 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  49.41 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  49.55 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  51.45 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  51.13 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  48.9 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  49.11 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.46 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  51 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  37.89 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  41.05 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  35.89 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.17 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.35 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.89 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.56 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.76 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  36.7 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.5 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  37.69 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.29 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.79 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.79 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.51 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.45 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.71 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>