More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0768 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  100 
 
 		 340 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  64.65 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  64.65 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  63.79 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  64.65 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  67.57 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  62.85 
 
 		 345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  55.29 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  56.27 
 
 		 339 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  59.27 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  59.27 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  55.96 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  57.46 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  58.2 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  57.98 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  58.2 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  58.2 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  57.89 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  56.59 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  56.44 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  58.8 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.82 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.82 
 
 		 341 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  58.82 
 
 		 341 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  59.12 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  59.87 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  58.78 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  58.47 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  56.74 
 
 		 340 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  57.65 
 
 		 346 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  50.47 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  51.88 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  49.03 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  49.27 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  49.27 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  49.5 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  46.41 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  47.34 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  46.27 
 
 		 350 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  46.99 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  49.68 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  49.09 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  47.08 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  47.08 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  46.99 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  46.99 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  47.08 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  45.62 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.64 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 371 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  40.92 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  40.18 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 345 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  43.01 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.79 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.11 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.13 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.83 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.01 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.6 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.6 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.27 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.27 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  37.17 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  37.02 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.95 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.95 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.33 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.18 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.35 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.83 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.83 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  35.5 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  39.58 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  35.5 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>