More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 358 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  73.19 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  51.83 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  47.02 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  46.25 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  44.44 
 
 		 348 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  41.87 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  43.08 
 
 		 340 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 405 aa  215  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  42.34 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  47.44 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  40.71 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 350 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  42.95 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  38.02 
 
 		 352 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.18 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  40.18 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  40.68 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  41.64 
 
 		 340 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  42.68 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  43.79 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.48 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  39.31 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 334 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.58 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.75 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.01 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.29 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.14 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.99 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.92 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  40.89 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 345 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 345 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  34.03 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.14 
 
 		 327 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.7 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.06 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  38.98 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  38.02 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  38.81 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  37.8 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  37.8 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  37.8 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  37.8 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>