More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4910 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 340 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  74.61 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  74.61 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  64.56 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  61.14 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  61.04 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.04 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  61.04 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  63.46 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  63.04 
 
 		 340 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  62.93 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  63.14 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  62.78 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  57.56 
 
 		 405 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  57.23 
 
 		 405 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  55.65 
 
 		 405 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  61.76 
 
 		 340 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.21 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  62.21 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  62.21 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.21 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  62.21 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  61.46 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  58.31 
 
 		 372 aa  318  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.54 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.54 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  62.54 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  53.33 
 
 		 352 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.89 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  56.95 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  57.88 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  51.7 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  49.37 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  46.97 
 
 		 344 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  49.38 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  50.49 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  50.49 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  52.25 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  47.4 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  52.23 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  52.58 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  51.19 
 
 		 346 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  47.78 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  47.37 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  51.84 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.27 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  41.23 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.4 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.19 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.58 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.09 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.31 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.46 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.02 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.79 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.02 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.04 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.51 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  36.1 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.73 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  36.1 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  36.1 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>