More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4097 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 349 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 349 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  69.54 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  66.86 
 
 		 351 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  59.16 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  59.82 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  59.82 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  51.59 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  55.36 
 
 		 345 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  58.53 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  59.29 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  57.77 
 
 		 346 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  57.77 
 
 		 346 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  58.86 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  49.54 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  52.23 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  56.6 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  53.4 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  53.4 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  53.4 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  48.83 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  50.61 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  50.61 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  51.23 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  46.06 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  50 
 
 		 337 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  49.38 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  50.61 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  50.62 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 340 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 336 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  51.92 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  51.92 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  51.92 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  51.92 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  50.31 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  50.51 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.92 
 
 		 341 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  51.31 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  49.1 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.6 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.27 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  51.27 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.86 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  48.16 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  40.56 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  38.14 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.11 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.48 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.22 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.22 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.71 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.77 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.64 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.3 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.91 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.58 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  34.58 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.96 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>