More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3039 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  100 
 
 		 371 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  57.99 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  47.35 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  52.61 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  45.67 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  45.37 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  45.27 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.12 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  42.46 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  44.24 
 
 		 357 aa  235  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  44.92 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  47.48 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  46.03 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  47.17 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.17 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  47.17 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  39.66 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  40.28 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  44.03 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  46.08 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  47.53 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  47.25 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  47.4 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  47.4 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  47.4 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  45.09 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  47.65 
 
 		 340 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 337 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  46.91 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  49.26 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  44.14 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  44.25 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  45.37 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  44.37 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  41.67 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  35.9 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.85 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.04 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.29 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.1 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.49 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.93 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  39.46 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.38 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.18 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.08 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  36.3 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  35.77 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.03 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 311 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 311 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.46 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>