More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3781 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  100 
 
 
340 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  99.12 
 
 
340 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  98.82 
 
 
340 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
340 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  99.12 
 
 
341 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  99.12 
 
 
341 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  99.71 
 
 
340 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  98.24 
 
 
341 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  86.18 
 
 
340 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  79.94 
 
 
345 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  80.83 
 
 
340 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  73.97 
 
 
340 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  70.68 
 
 
339 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  71.07 
 
 
332 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  71.07 
 
 
332 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  69.64 
 
 
336 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  68.98 
 
 
336 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  63.98 
 
 
330 aa  348  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  61.64 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  64.46 
 
 
337 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  64.46 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  58.36 
 
 
352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  53.46 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  58.1 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  58.1 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  56.67 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  62.21 
 
 
340 aa  318  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  56.21 
 
 
372 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  59.49 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  57.85 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  50.15 
 
 
344 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  52.1 
 
 
323 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  45.06 
 
 
368 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  46.73 
 
 
348 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  45.13 
 
 
350 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  50.96 
 
 
349 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  50.96 
 
 
349 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  49.69 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  47.46 
 
 
351 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  49.85 
 
 
346 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  50.15 
 
 
347 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  50.15 
 
 
347 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  48.12 
 
 
343 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  51.45 
 
 
346 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  51.13 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  49.06 
 
 
343 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  46.95 
 
 
371 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  49.85 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.76 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  51 
 
 
346 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  37.89 
 
 
357 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  43.92 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 
345 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.25 
 
 
333 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
323 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.5 
 
 
322 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.42 
 
 
322 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.99 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.87 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 
350 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.33 
 
 
324 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.26 
 
 
327 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  36.7 
 
 
321 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 
312 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 
321 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
322 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.17 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.95 
 
 
322 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 
306 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 
342 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 
342 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.89 
 
 
322 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.97 
 
 
334 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
309 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.45 
 
 
323 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
310 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 
318 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
324 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
311 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>