More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3834 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3834  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.185359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.39 
 
 
255 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.03 
 
 
271 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  46.67 
 
 
263 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
276 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  46.77 
 
 
255 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  45.56 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.82 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  46.37 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  42.61 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  45.16 
 
 
255 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  45.42 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  46 
 
 
250 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  48.57 
 
 
610 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.88 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  44.03 
 
 
259 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  44.53 
 
 
261 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46 
 
 
334 aa  214  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 
273 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.4 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.4 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.4 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  43.6 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  45.42 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
259 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.58 
 
 
259 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.78 
 
 
280 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
260 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  43.48 
 
 
261 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
589 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.95 
 
 
259 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  41.4 
 
 
307 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  45.16 
 
 
256 aa  208  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.91 
 
 
258 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
255 aa  207  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  45.97 
 
 
589 aa  207  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
294 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  46 
 
 
274 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  48 
 
 
270 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
293 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.14 
 
 
252 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.25 
 
 
589 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  48.02 
 
 
270 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.95 
 
 
283 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  42.51 
 
 
258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  42.51 
 
 
258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  42.51 
 
 
258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.38 
 
 
265 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.11 
 
 
258 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  42.63 
 
 
271 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
270 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  46.4 
 
 
583 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  44.84 
 
 
590 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  43.7 
 
 
264 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  44.66 
 
 
648 aa  204  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  41.41 
 
 
612 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  42.52 
 
 
594 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.38 
 
 
264 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  42.19 
 
 
256 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.87 
 
 
258 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  44 
 
 
260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  41.67 
 
 
260 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  41.67 
 
 
260 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.13 
 
 
594 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  42.52 
 
 
594 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.63 
 
 
259 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  43.95 
 
 
260 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 
608 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
250 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  42.23 
 
 
256 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 
257 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  42.13 
 
 
594 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  42.13 
 
 
594 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  42.13 
 
 
594 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  41.04 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  42.13 
 
 
594 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  41.3 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  40.87 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.54 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  40.48 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  46.18 
 
 
652 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
271 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.4 
 
 
333 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  45.24 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  46.37 
 
 
663 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  41.13 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  41.13 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  45.38 
 
 
652 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
254 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  42.11 
 
 
257 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.52 
 
 
594 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>