More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2990 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2990  aminotransferase, class V  100 
 
 		 401 aa  823    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.46909  normal  0.329758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.75 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  40.47 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.49 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.27 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.82 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.32 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.67 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0272  cysteine desulfurase  42.46 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.28 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.56 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  37.31 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.76 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  41.43 
 
 		 1135 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.38 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2435  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3260  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.861721  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.25 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0134  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.08 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  37.31 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.16 
 
 		 379 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  38 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  38 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  39 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  39 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  38 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  38.14 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.76 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 492 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  37.75 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 404 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.08 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.72 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  37.31 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.72 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  37.91 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  38.69 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  39.55 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  41.55 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  39.02 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3438  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  37.94 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.39 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3912  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.26 
 
 		 388 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  38.34 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 404 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2080  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.27 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  36.57 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.02 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  37.31 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  37.18 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  40.85 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  40.89 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  37.97 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  38.56 
 
 		 1143 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.24 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  37.08 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 373 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3065  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 384 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3220  aminotransferase, class V  40.83 
 
 		 396 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.135316  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  37.5 
 
 		 405 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.27 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1413  cysteine desulfurase  36.3 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.156038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  37.72 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  39.43 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  37.94 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  37.84 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  37.76 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 508 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  36.75 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  36.06 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  36.88 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  39.08 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>